24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2545 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  46.43 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  44.53 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 		 288 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  36.29 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  36.13 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  32.33 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  34.86 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  32.58 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  31.01 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  29.92 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  28.38 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  26.15 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  28.8 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>