30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1336 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 140 aa  297  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  48.92 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  51.11 
 
 		 218 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  50.37 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  45.93 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  46.83 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  32.8 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  28.37 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  27.87 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  32.03 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  27.4 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  26.19 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  29.08 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  28 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  26.19 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  27.42 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  27.42 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  27.42 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  30.09 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  23.02 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  33.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  33.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3076  hypothetical protein  26.72 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>