34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0429 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  68.18 
 
 
138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  64.29 
 
 
146 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  61.72 
 
 
282 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  58.27 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  58.27 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  58.27 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  55.04 
 
 
286 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  53.72 
 
 
129 aa  140  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  33.85 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  36 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  30.95 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  38.26 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  33.59 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 
288 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  29.6 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  29.51 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  29.51 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  29.92 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  34.83 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  34.83 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  30.51 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  31.3 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  32.31 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4101  hypothetical protein  35.9 
 
 
182 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46080  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.819422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  29.77 
 
 
125 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  22.73 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3919  hypothetical protein  28.15 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>