30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1333 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  94.33 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  83.2 
 
 		 125 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  56.2 
 
 		 141 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  56.2 
 
 		 218 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  47.86 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  45.32 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  37.1 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  35.66 
 
 		 282 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  36.8 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  38.4 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  34.13 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  38.4 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  38.4 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  38.21 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  30.56 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  35.2 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  30.5 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  25.9 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  28.37 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  29.55 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  29.07 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  29.07 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  28.79 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6336  hypothetical protein  29.03 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>