31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2146 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  316  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  96.62 
 
 
148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  51.85 
 
 
141 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  47.86 
 
 
141 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  47.14 
 
 
218 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  45.93 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  45.19 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  45.93 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  45.19 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  46.03 
 
 
125 aa  129  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  36.88 
 
 
143 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  30.88 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  30.37 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  27.66 
 
 
282 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  29.51 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  30.87 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  29.51 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  30.87 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.92 
 
 
288 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  28.33 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  33.66 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  25.2 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  35.96 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  35.96 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0773  hypothetical protein  24.44 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  hitchhiker  0.00671435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3076  hypothetical protein  28.23 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>