26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  100 
 
 
146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  50.7 
 
 
286 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  48.25 
 
 
282 aa  150  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  30.37 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  30.37 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  31.2 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  27.41 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  25.93 
 
 
218 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  23.02 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  28.91 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  21.74 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  24.79 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  28.91 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  25.19 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  28.1 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  28.24 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  28.24 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  28.24 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  22.73 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>