24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2557 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  53.54 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  53.54 
 
 
131 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2623  hypothetical protein  52.76 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3849  hypothetical protein  50.77 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240023  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  51.18 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  48 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  47.58 
 
 
131 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3299  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4598  hypothetical protein  37.1 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.947739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4131  hypothetical protein  33.07 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  27.43 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  25.2 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  29.77 
 
 
132 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  26.98 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4192  hypothetical protein  26.61 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586568  hitchhiker  0.00703334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>