18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4131 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4131  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  48.39 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  42.4 
 
 
141 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  36.59 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  36.72 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  36.72 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  36.72 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  36.72 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  36.72 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2623  hypothetical protein  36.22 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  33.07 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  36.22 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3849  hypothetical protein  34.65 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240023  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  35.43 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3299  hypothetical protein  35.43 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4598  hypothetical protein  30.4 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.947739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>