29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3100 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  62.02 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  59.69 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  47.58 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3849  hypothetical protein  53.08 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240023  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  51.91 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4131  hypothetical protein  48.39 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2623  hypothetical protein  51.54 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  51.15 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  51.56 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3299  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4598  hypothetical protein  42.4 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.947739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  31.15 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0928  hypothetical protein  31.09 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1492  hypothetical protein  30.43 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  30.56 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4192  hypothetical protein  27.43 
 
 		 129 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586568  hitchhiker  0.00703334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  27.35 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1663  hypothetical protein  30.7 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>