20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0681 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  99.24 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2623  hypothetical protein  86.26 
 
 
131 aa  223  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3849  hypothetical protein  85.5 
 
 
131 aa  222  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240023  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  77.27 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3299  hypothetical protein  76.52 
 
 
133 aa  192  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  77.69 
 
 
130 aa  186  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  58.73 
 
 
133 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  53.54 
 
 
125 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  50.76 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  51.15 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4598  hypothetical protein  34.88 
 
 
130 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.947739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4131  hypothetical protein  36.72 
 
 
136 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  29.46 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  24.19 
 
 
125 aa  40.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>