20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2120 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0928  hypothetical protein  36.72 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1972  hypothetical protein  30.83 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432396  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0931  hypothetical protein  33.05 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  32.03 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1318  hypothetical protein  30.33 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4449  hypothetical protein  27.34 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0113255  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  34.75 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  31.03 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  30.33 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3276  hypothetical protein  25.21 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0681  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0656  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>