14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0928  hypothetical protein  89.7 
 
 		 163 aa  287  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1972  hypothetical protein  52.56 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  52.5 
 
 		 125 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0931  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  37.82 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  25.95 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  31.15 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  31.15 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  27.11 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  30.25 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0137  hypothetical protein  34.62 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  22.53 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  27.05 
 
 		 318 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>