16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0928 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0928  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  330  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  298  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1972  hypothetical protein  57.48 
 
 
165 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432396  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  52.5 
 
 
125 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0931  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2120  hypothetical protein  37.82 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  31.09 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  31.09 
 
 
131 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  30.25 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  25.81 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  25.27 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  25.17 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0137  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  27.27 
 
 
121 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>