27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4723 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  96.82 
 
 
157 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  83.33 
 
 
160 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  82.05 
 
 
160 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  78.74 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  33.06 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  26.75 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  31.36 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  29.13 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  28.23 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  25.37 
 
 
318 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.75 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  27.63 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  32 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  30.95 
 
 
133 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  28.7 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  25.49 
 
 
466 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  26.92 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4192  hypothetical protein  25.66 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586568  hitchhiker  0.00703334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  25 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  25.64 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  27.92 
 
 
159 aa  40.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>