14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6259 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  93.12 
 
 		 160 aa  313  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  82.05 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  82.05 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  80.13 
 
 		 157 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  75.62 
 
 		 196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  33.59 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  33.83 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  30.25 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  29.01 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  24.84 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  28.79 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0897201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>