31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3899 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  317  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1663  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1587  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  28.57 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  30.56 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0137  hypothetical protein  32.85 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2357  putative signal peptide protein  28.23 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0291503  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  30.52 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  28.08 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  28.08 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  26.52 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  47.83 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  30.65 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  25.69 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  31.06 
 
 
126 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  30.08 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  25.79 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4461  putative signal peptide protein  29.41 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1972  hypothetical protein  32.05 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432396  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  32.86 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  27.97 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  27.2 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  32.86 
 
 
188 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  31.96 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  26.5 
 
 
168 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>