12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3898 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  32.53 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  35.54 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  32.7 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  27.85 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  32.5 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  29.66 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  26.05 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>