21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4734 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  28.57 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  29.01 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  28.24 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  32.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  28 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2357  putative signal peptide protein  31.15 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0291503  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  27.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  30.56 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1663  hypothetical protein  28.7 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1587  hypothetical protein  28.7 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  28.12 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  28.81 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  30.1 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0137  hypothetical protein  23.53 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  23.68 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  23.18 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  24.43 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  25.74 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>