19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2342 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  64.02 
 
 
188 aa  255  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  67.03 
 
 
189 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  62.64 
 
 
189 aa  242  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  54.34 
 
 
187 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  57.89 
 
 
194 aa  187  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  56.77 
 
 
192 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  56.13 
 
 
192 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  56.77 
 
 
191 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  54.43 
 
 
191 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  54.43 
 
 
191 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  54.43 
 
 
191 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  54.43 
 
 
191 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  54.43 
 
 
191 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  54.6 
 
 
192 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  55.92 
 
 
186 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  46.15 
 
 
176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  25.41 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  23.18 
 
 
141 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>