20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2545 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  394  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  74.6 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  72.62 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  62.64 
 
 		 194 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  52.22 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  56.58 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  56.49 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  54.61 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  54.61 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  53.95 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  48.77 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  23.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  22.53 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>