20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2118 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  366  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  55.83 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  50.96 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  48.77 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  45.03 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  49.04 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  47.24 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  47.24 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  47.24 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  43.86 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  45.62 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  25.41 
 
 		 318 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  24.43 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>