42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1942 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  361  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  91.93 
 
 		 174 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  57.14 
 
 		 168 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  59.85 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  58.39 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  58.87 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  46.5 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  45.22 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  43.56 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.08 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  47.33 
 
 		 155 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  43.83 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  51.64 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  46.32 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  49.6 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  40.61 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  52 
 
 		 353 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  49.18 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  49.57 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  47.86 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  43.59 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  50.94 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  38.26 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  37.39 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  36.51 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  35.09 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  32.2 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  27.05 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  27.59 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  28.21 
 
 		 130 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  28.21 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  26.5 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  52.63 
 
 		 74 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  30.1 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  27.56 
 
 		 150 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  25.15 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  22.3 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7236  hypothetical protein  25.38 
 
 		 123 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.150795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>