35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3321 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  353  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  90.37 
 
 		 145 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  79.31 
 
 		 145 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  64.75 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  57.02 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.14 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  41.67 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  41.8 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  40.17 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  40.52 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  38.46 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  36.92 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  41.38 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  39.32 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.16 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  36.75 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  31.65 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  35.96 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  38.14 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  34.56 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  35.71 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  35.38 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  38.33 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  37.1 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.19 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.17 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  33.61 
 
 		 353 aa  54.3  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  32.17 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  28.23 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  28.44 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>