38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5447 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  100 
 
 		 143 aa  300  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  77.54 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  74.31 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  59.42 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  58.21 
 
 		 155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  61.6 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  60.32 
 
 		 190 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  57.35 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  56.3 
 
 		 152 aa  156  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  55.38 
 
 		 164 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  53.79 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  54.2 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  54.76 
 
 		 188 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.81 
 
 		 189 aa  143  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  49.61 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  54.47 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  46.36 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  50.7 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.61 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  55.56 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  48.8 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  49.6 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  48.8 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  41.61 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  40.52 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  39.66 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  38.74 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  31.45 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  33.9 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  28 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  44.9 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  24.8 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  24.43 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7236  hypothetical protein  22.32 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  24 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  24.8 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>