35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3003 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  74.31 
 
 
143 aa  232  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  71.03 
 
 
158 aa  217  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  61.43 
 
 
154 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  53.95 
 
 
161 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  56.25 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  58.87 
 
 
164 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  57.26 
 
 
152 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  49.36 
 
 
156 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.65 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  56.35 
 
 
190 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.47 
 
 
188 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  54.47 
 
 
152 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.12 
 
 
189 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  49.37 
 
 
168 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  48.06 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  51.59 
 
 
174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  52.8 
 
 
353 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  47.13 
 
 
164 aa  124  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  60.4 
 
 
159 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  54.47 
 
 
149 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  47.95 
 
 
164 aa  120  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  47.79 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  41.91 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  37.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  34.68 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  31.82 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  28.81 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  51.22 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  27.87 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  27.92 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  27.92 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  27.92 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>