45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4136 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  46.51 
 
 
174 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  49.15 
 
 
149 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  39.13 
 
 
168 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  45.64 
 
 
188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  47.86 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  44.44 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  45.38 
 
 
190 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  41.88 
 
 
164 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  41.3 
 
 
152 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  46.67 
 
 
189 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  40 
 
 
158 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  40.25 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  38.78 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.67 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  41.33 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  39.1 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  41.61 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  41.67 
 
 
353 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  40.17 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  39.84 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  37.04 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  37.24 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.88 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  41.67 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  36.89 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  39.8 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  31.5 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4101  hypothetical protein  29.7 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  31.58 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  26.23 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  30.88 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  30.88 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  30.88 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  26.05 
 
 
131 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  34.75 
 
 
135 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  24.12 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  31.53 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>