14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7088 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  41.46 
 
 
143 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  36.8 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  35.78 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  34.92 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  34.92 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2709  hypothetical protein  38.78 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.983516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  31.06 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  29.6 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  23.39 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  32.28 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1147  hypothetical protein  32.14 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000230481  hitchhiker  0.0000000000000469186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  31.53 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0878  hypothetical protein  30.34 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>