41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03100 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  100 
 
 		 158 aa  329  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  77.54 
 
 		 143 aa  235  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  71.03 
 
 		 159 aa  217  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  53.42 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  54.05 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  62.7 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  57.89 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.67 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  54.74 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  53.73 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  57.14 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50.35 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.04 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  49.38 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  52.03 
 
 		 353 aa  131  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  51.2 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  49.24 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  48.48 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  47.01 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  48.39 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  57.43 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  40.44 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  38.33 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.49 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  29.57 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  30.89 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  28.19 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3597  hypothetical protein  26.88 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.50522  decreased coverage  0.00580211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  27.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  27.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  24.14 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  25.86 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  25 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>