43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4181 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  348  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  60.65 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  59.35 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  52.94 
 
 		 149 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.88 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.82 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  51.09 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  50.76 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  49.37 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  49.38 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  53.23 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  48.1 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50.7 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.85 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  42.94 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.28 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  48.91 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  42.86 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  44.67 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  40.12 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  48.84 
 
 		 353 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  44.88 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  41.41 
 
 		 132 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  38.69 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  37.32 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  38.6 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  35.96 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  30.07 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  31.2 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  27.39 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  26.75 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  26.75 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  27.48 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  28.69 
 
 		 128 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  26.5 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  25.95 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  26.27 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  24.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  25.42 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  45.95 
 
 		 74 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>