44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2132 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  91.93 
 
 		 174 aa  313  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  58.33 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  59.12 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  57.66 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  58.06 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  46.39 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  48.85 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  45.4 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.93 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  47.79 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  42.42 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  44.59 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  43.83 
 
 		 158 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  42.07 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.99 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  52.46 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  47.52 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  46.51 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  48.8 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  44.23 
 
 		 154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  50.4 
 
 		 353 aa  114  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  50.94 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  36.51 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  37.39 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  36.52 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  30.51 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  29.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  51.6  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  25.41 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.06 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  55.26 
 
 		 74 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  29.92 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  24.54 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  27.35 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  24.54 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  24.54 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7236  hypothetical protein  33.87 
 
 		 123 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.150795 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  39.53 
 
 		 484 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  25.74 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>