25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1672 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  76.92 
 
 
130 aa  215  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  75.57 
 
 
148 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  68.7 
 
 
131 aa  202  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  72.52 
 
 
131 aa  200  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  42.28 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.69 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  28.8 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  29.17 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  29.03 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  30.17 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.6 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  29.06 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  26.27 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  26.67 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  28.21 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.03 
 
 
156 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  26.4 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  26.5 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  24.43 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  26.5 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  27.64 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  26.09 
 
 
353 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  24.14 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>