36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5387 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 154 aa  323  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  59.42 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  61.43 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  58.65 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  54.05 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  62.4 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.32 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.63 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  54.69 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.56 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  56.35 
 
 		 190 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.12 
 
 		 189 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.38 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  61.76 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  48.19 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  53.66 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  48.19 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  49.62 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  48.91 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  47.97 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  44.9 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  44.22 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  38.89 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  39.84 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  41.38 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  36.89 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  31.43 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  26.4 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  26.4 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  28.45 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  29.6 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2918  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  24 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>