34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3628 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  100 
 
 
151 aa  309  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  64.75 
 
 
170 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  60.9 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  65.04 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  47.92 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.88 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.29 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  35.29 
 
 
190 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  31.43 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  33.87 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  34.81 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  36.51 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  36.51 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  30.07 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  33.06 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  32.56 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  32.09 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  34.56 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  33.87 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  33.9 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  33.59 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  29.49 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  31.53 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.69 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  28.35 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  29.6 
 
 
353 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  31.82 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  28.81 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  25.35 
 
 
148 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  26.15 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  25.4 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  33.9 
 
 
159 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>