42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3188 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  71.89 
 
 		 188 aa  278  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  62.57 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  62.7 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  60.32 
 
 		 143 aa  158  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  56.35 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  56.35 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  50.76 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  48.2 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.91 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  52.27 
 
 		 353 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50 
 
 		 152 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  50.39 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  48.06 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  52.85 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  52.03 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  47.14 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  47.52 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  45.38 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  45.6 
 
 		 159 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  36.44 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  35.29 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  34.33 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  31.65 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  36.44 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  29.51 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.03 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  28.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  51.16 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  30.43 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  28.45 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  28.17 
 
 		 125 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>