43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0874 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  100 
 
 
188 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  71.89 
 
 
190 aa  278  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  63.93 
 
 
189 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  57.14 
 
 
158 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.88 
 
 
168 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  54.76 
 
 
143 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  55.47 
 
 
159 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.34 
 
 
156 aa  141  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  52.38 
 
 
154 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  52.34 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.59 
 
 
152 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  52.63 
 
 
353 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.18 
 
 
161 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  46.88 
 
 
152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  55.93 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  48.87 
 
 
149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  48.41 
 
 
155 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  49.66 
 
 
164 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  55.08 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  48.44 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  47.59 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  45.64 
 
 
156 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  99  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  37.29 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  34.82 
 
 
145 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  36.44 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  31.15 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  27.87 
 
 
128 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  29.51 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  26.61 
 
 
131 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  29.6 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  29.6 
 
 
131 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  42.11 
 
 
74 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  29.75 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3597  hypothetical protein  29.73 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.50522  decreased coverage  0.00580211 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  28.21 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  28.7 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00390  putative orphan protein  27.11 
 
 
141 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>