36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1555 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  100 
 
 
189 aa  394  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  62.57 
 
 
190 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  63.93 
 
 
188 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  55.12 
 
 
154 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  55.04 
 
 
158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  55.81 
 
 
143 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2035  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  51.97 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  55.12 
 
 
159 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2336  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  53.54 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1905  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  50 
 
 
152 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4027  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.16 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.881449 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  51.54 
 
 
353 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  45.07 
 
 
152 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  52.03 
 
 
149 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2135  hypothetical protein  48.03 
 
 
155 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  53.39 
 
 
164 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  52.99 
 
 
174 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  45.89 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  51.28 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1163  hypothetical protein  49.61 
 
 
164 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  49.57 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3607  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0125951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  46.67 
 
 
156 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1120  hypothetical protein  49.49 
 
 
159 aa  91.3  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.743202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  34.81 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  35.29 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  33.93 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  37.19 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  31.16 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  31.2 
 
 
131 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  31.15 
 
 
131 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  28.69 
 
 
130 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  30.4 
 
 
148 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3120  hypothetical protein  51.22 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.43305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  27.64 
 
 
131 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>