24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1538 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1639  hypothetical protein  79.23 
 
 		 148 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1672  hypothetical protein  76.92 
 
 		 131 aa  215  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1153  hypothetical protein  76.15 
 
 		 131 aa  207  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000819636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1339  hypothetical protein  72.66 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0663  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00920211  normal  0.0201094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  31.4 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  31.15 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1337  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  31.9 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  28.81 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3321  hypothetical protein  30.58 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  29.91 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39236  predicted protein  29.41 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1952  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3628  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  26.15 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0704877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1555  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  28.69 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  28.21 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2594  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  27.05 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  28.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  30.25 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  25.86 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5447  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  24.8 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5387  hypothetical signal peptide protein  24 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>