28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3881 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  96.82 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  96.82 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  81.41 
 
 		 160 aa  267  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  80.13 
 
 		 160 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  78.74 
 
 		 196 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  32.23 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  27.39 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  30.51 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  29.03 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  34.38 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0874  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  29.75 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03100  putative signal peptide protein  28.19 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.750749  normal  0.99312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  25.37 
 
 		 318 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  32 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  28.7 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1923  hypothetical protein  25.53 
 
 		 142 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7314  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4192  hypothetical protein  25.66 
 
 		 129 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586568  hitchhiker  0.00703334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2132  hypothetical protein  25.64 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  23.72 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3003  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  27.92 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.904865  normal  0.522678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  26.5 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>