30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0954 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  45.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  40.98 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  36.8 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  41.07 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  39.17 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  37.17 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  37.7 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  35.34 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  38.33 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  35.77 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  38.52 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  35.83 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  28.21 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  28.1 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  29.84 
 
 		 387 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 387 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 387 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  35.59 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  33.06 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4136  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  34.75 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4152  hypothetical protein  26.15 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507764  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.73 
 
 		 387 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47110  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>