14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_47110  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4065  hypothetical protein  97.78 
 
 
135 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  48.06 
 
 
134 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0653  hypothetical protein  48.06 
 
 
130 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0946  ketosteroid isomerase related protein  42.86 
 
 
138 aa  114  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0185777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03812  Ketosteroid isomerase like protein  38.46 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  37.27 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  30.63 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  33.03 
 
 
135 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
387 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.57 
 
 
387 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  31.5 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
387 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>