22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4697 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  49.17 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  44.26 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  47.29 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  39.66 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  37.27 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  41.07 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  35.4 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  32.43 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  32.74 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  33.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 387 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  36.75 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0653  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47110  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4065  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  31.62 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  32.48 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>