15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2188 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  32.2 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  27.35 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  30.51 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  28.21 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  27.59 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  25.42 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  27.12 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  38.3 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  29.27 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>