10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2598 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  33.05 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  28.1 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  27.68 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  32.86 
 
 		 387 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>