37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2619 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  45.69 
 
 
141 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  45.3 
 
 
136 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  40.98 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  38.66 
 
 
387 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  37.27 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  36.89 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  32.23 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  36.67 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  33.61 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4152  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507764  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47110  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  33.06 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4065  hypothetical protein  32.43 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  31.45 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  26.19 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  26.98 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  28.93 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0653  hypothetical protein  27.91 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  29.46 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0946  ketosteroid isomerase related protein  28.68 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0185777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  28.33 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  29.81 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10080  hypothetical protein  26.77 
 
 
125 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466848  normal  0.805949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2970  hypothetical protein  26.27 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2878  hypothetical protein  27.13 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00543287  hitchhiker  0.000193701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  26.67 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  29.84 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1172  hypothetical protein  27.34 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0188843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3141  hypothetical protein  27.34 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335339  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1249  hypothetical protein  27.34 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3586  hypothetical protein  28.86 
 
 
174 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>