22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3143 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  36.8 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  32.2 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  33.05 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  31.93 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  30.36 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  35.54 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4152  hypothetical protein  32.81 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507764  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  31.9 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  29.51 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  26.96 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  28.7 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  31.9 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  35.14 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  33.04 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  35.14 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  29.69 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  29.31 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>