15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1204 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  94.21 
 
 		 122 aa  236  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  74.58 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  61.54 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  44.14 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  45.79 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  43.75 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  40.17 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  40.71 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  41.03 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  43.36 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  35.14 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>