14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3751 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  53.44 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  47.29 
 
 
135 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  45.3 
 
 
148 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  35.48 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  37.61 
 
 
387 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  37.17 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  34.65 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
387 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  33.91 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  35.54 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 
387 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  35.9 
 
 
387 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  30.51 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>