20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4708 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  39.66 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  37.29 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  29.57 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  34.65 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2288  hypothetical protein  30.6 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  35.96 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  33.05 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  33.62 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  32.73 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  24.77 
 
 		 387 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  29.73 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  29.81 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.41 
 
 		 387 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1663  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1587  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  29.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>