20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2084 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3751  putative hydrolase  53.44 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  49.17 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  45.69 
 
 
148 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  38.21 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  45.69 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
387 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  34.17 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
387 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  32.79 
 
 
387 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  29.51 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47110  hypothetical protein  30.63 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4152  hypothetical protein  30.58 
 
 
128 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507764  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  30.23 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  33.94 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4065  hypothetical protein  29.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2598  hypothetical protein  27.68 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  31.82 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>