11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4152 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4152  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  257  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507764  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  32.81 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  30.58 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 387 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 387 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.67 
 
 		 387 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4706  hypothetical protein  51.28 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4446  hypothetical protein  27.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>